尾声，因涉及20年前旧案，新佛尼号案件被移交给东京警视厅处理。鲸井定雄20年前的抢劫案、杀死叶才三的事件，因过了法律追诉期都不再追究。但他为了独吞赃款连续杀死龟田照吉、蟹江是久，又将服部平次击落大海，因此法庭加重判处了30年徒刑。海老名稔为爱人美海报仇，携带炸弹上船，差点给所有在船人员造成危害，但所幸最后无事，在鲛崎岛治的说情下，警方拘役海老名3个月，以示惩罚。毛利小五郎因破获新佛尼号连续杀人案件，东京警视厅给以a级奖励。鲛崎、千钧、平次因协助破案有功，也被给以了c级奖励。
当然，柯南同学是一毛钱也捞不着的。回到东京后，在阿笠宅，柯南自然是牢骚满腹，灰原照旧嘲讽一番。猛然见，千钧想起一个问题，“毛利大叔今年是37岁吧？我记得他说过20岁上大学时，他们夫妇就有了小兰……”柯南道，“是啊，有什么问题吗？”千钧道，“问题大发了，我的大侦探！我问你，叶才三他们4人抢劫银行的案件发生哪一年？”阿笠博士奇怪，“20年前啊！”千钧道，“那20年前的话，毛利大叔岂不是才17岁？应该还在上高中吧！怎么可能是鲛崎组长的助手呢？”
柯南有些发蒙，一时间不知道该怎么答话。灰原也皱起眉头，“是啊，的确很奇怪。会不会毛利跟你们一样，在高中生时代就协助警方办案了？”柯南摇头，“应该不是，鲛崎组长亲口说过，他们是一起追查那起案件的负责人。如果大叔只是作为高中生简单地协助，他就不会这样说了。”阿笠博士道，“而且警方应该也不会找一个寂寂无名的高中生来协助调查如此惊天大案。除非毛利当年也有新一这样的名声，或者像服部平次一样，有身在高位的父亲。”灰原分析，“如果他真的很厉害，那件4亿元银行抢劫案，也不会等了20年才告破。那么，剩下的就只能是……”
为了问清原委，柯南以工藤新一的名义，打电话给目暮警官询问此事。目暮警官回答，“那的确是20年前的案子，这一点不会错的。但那时候，毛利因为一个特殊的原因，介入了此案，作为鲛崎的助手一起追查案件。”其他再详细的情况，因涉及到保密的问题，目暮就不肯透露了。千钧感叹，“果然，毛利大叔，也是个深藏不露的人物啊！”柯南不相信，“除了喝酒以外，我实在看不出大叔有哪点深藏不露的！而且，我和小兰从小一起长大，也从未听说过大叔有什么显赫的身世……”灰原支持千钧，“毛利小五郎背后必定有我们不知道的秘密！”